Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Spocd1B1ASB6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Spocd1B1ASB6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spocd1B1ASB6 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spocd1B1ASB6 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms