Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lcn6A2AJB9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lcn6A2AJB9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lcn6A2AJB9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms