Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cyb561d1A2AE42 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cyb561d1A2AE42 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms