Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc173A0JLY1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc173A0JLY1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc173A0JLY1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc173A0JLY1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms