Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrit3W8DXL4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Lrit3W8DXL4 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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