Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm3550W4VSN7 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm3550W4VSN7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms