Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm20714-202ENSMUST00000176436 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csmd2V9GX34 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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