Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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