Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
CcniQ9Z2V9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms