Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Knop1Q9Z2Q2 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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