Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Vamp5Q9Z2P8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms