Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ubl3Q9Z2M6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ubl3Q9Z2M6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms