Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Cldn7Q9Z261 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms