Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
RfxankQ9Z205 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms