Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
VarsQ9Z1Q9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms