Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

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Length 792 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Nek4Q9Z1J2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Nek4Q9Z1J2 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nek4Q9Z1J2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nek4Q9Z1J2 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Nek4Q9Z1J2 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nek4Q9Z1J2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms