Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
Tnip1Q9WUU8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tnip1Q9WUU8 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms