Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ptpn4Q9WU22 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ptpn4Q9WU22 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 178.1 ms