Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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Vax2Q9WTP9 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms