Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Psma1Q9R1P4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms