Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Col4a4Q9QZR9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Col4a4Q9QZR9 1700012P22Rik-201ENSMUST00000030323 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Col4a4Q9QZR9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Col4a4Q9QZR9 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Col4a4Q9QZR9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Col4a4Q9QZR9 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Col4a4Q9QZR9 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Col4a4Q9QZR9 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Col4a4Q9QZR9 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Col4a4Q9QZR9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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