Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tomm40Q9QYA2 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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