Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
VapbQ9QY76 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
VapbQ9QY76 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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