Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Kcnip3Q9QXT8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms