Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Dkk3Q9QUN9 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
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Dkk3Q9QUN9 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Dkk3Q9QUN9 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Dkk3Q9QUN9 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Dkk3Q9QUN9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
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Dkk3Q9QUN9 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Dkk3Q9QUN9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
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Dkk3Q9QUN9 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Dkk3Q9QUN9 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms