Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Rabgef1Q9JM13 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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