Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Tgm1Q9JLF6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Tgm1Q9JLF6 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms