Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS4

Ldb3, LIM domain-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb3Q9JKS4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ldb3Q9JKS4 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Ldb3Q9JKS4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms