Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT6

Bap18, Chromatin complexes subunit BAP18, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap18Q9DCT6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Bap18Q9DCT6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms