Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ5

Ndufa8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa8Q9DCJ5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ndufa8Q9DCJ5 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ndufa8Q9DCJ5 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms