Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms