Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SrpraQ9DBG7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms