Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ftsj3Q9DBE9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms