Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Pop5Q9DB28 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Pop5Q9DB28 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Pop5Q9DB28 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pop5Q9DB28 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pop5Q9DB28 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Pop5Q9DB28 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
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Pop5Q9DB28 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms