Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Cldn34b2Q9D9N2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn34b2Q9D9N2 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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