Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Rnf138rt1Q9D9M9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms