Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp12Q9D9M2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp12Q9D9M2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp12Q9D9M2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Usp12Q9D9M2 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp12Q9D9M2 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp12Q9D9M2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Usp12Q9D9M2 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Usp12Q9D9M2 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usp12Q9D9M2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms