Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Q9D8L0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Q9D8L0 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms