Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl4Q9D8E6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rpl4Q9D8E6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms