Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cldn22Q9D7U6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Cldn22Q9D7U6 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
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