Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Chmp4cQ9D7F7 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chmp4cQ9D7F7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms