Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Nop56Q9D6Z1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Nop56Q9D6Z1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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Nop56Q9D6Z1 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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Nop56Q9D6Z1 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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