Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J7

Phf6, PHD finger protein 6, mousemouse

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf6Q9D4J7 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Phf6Q9D4J7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Phf6Q9D4J7 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Phf6Q9D4J7 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Phf6Q9D4J7 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms