Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Lonrf3Q9D4H7 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lonrf3Q9D4H7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms