Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms