Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Mrpl28Q9D1B9 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Mrpl28Q9D1B9 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms