Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Ss18l2Q9D174 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.6 ms