Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms