Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2e1Q9D0D5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gtf2e1Q9D0D5 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms