Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Mis12Q9CY25 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms